Archiv štítku: DNA

23andMe

23andMe je firma poskytující genové analýzy (DNA testy) a genealogické informace přímým spotřebitelům.

Za 99$ poskytují genealogické informace a surová data obsahující individuální SNP pro další analýzu. 23andMe využívá služeb LabCorp a čip Illumina HumanOmniExpress-24 format, který poskytuje data o 733 tisících standardních a dalších 200 tis. individuálně připravených SNP pro 23andMe.

Soudní případ 23andMe vs Lisa Casey

Data lze získat ve formátu textového souboru s cca 900 tis. řádky:
id snp = rs (reference SNP id) / číslo chromozomu / pozice / genotyp
např.
rs4477212 1 82154 AA

Gelová elektroforéza

Gelová elektroforéza Wiki
Rozdíl mezi běžným a žraločím hřebenem

OpenWetWare Open gel box
K označení DNA po gelové elektroforéze lze využít osvětlení modrým světlem (bez narušení jako u UV světla) Pearl Biotech Blue Transluminator v ceně 299USD

    Možné barvy

  • SYBR Safe
  • SYBR Green I
  • GelGreen
  • GRSafe
  • Ethidium Bromide

Přehled a vlastnosti barev na zvýraznění DNA
Srovnání iluminátorů od různých dodavatelů

Boxy na elektroforézu Thermo scientific, Alibaba NanBei

DNA databáze

Iniciativa propojující genové databanky International Nucleotide Sequence Database Collaboration
Japonská DNA Databanka
Volně dostupná data z medicínských výzkumů European Bioinformatics Institute
National Center for Biotechnology Information informační videa

Vzorky bakterií, plísní a virů ATCC ATCC Wikipedia. ATCC je soukromá nezisková organizace zaměřená na uchování biologických vzorků.

SNPs – single nucleotide polymorfismus
SNPedia databáze zjištěných SNP a jejich výskyt v literatuře.
Promethease jednoduchý způsob analýzy SNP např. z dat od 23 and me.
Nástroje pro analýzu surových dat z 23andMe, AncestryDNA nebo Family Tree DNA Family Finder testů.

Human proteome project bílkoviny, enzymy, protilátky.

BEI Resources – bezplatná databáze vzorků virů, bakterií pro výzkum.

Mybiosource.com dodavatel protilátek a ELISA kitů

Biocompare nákupní portál pro humánní medicínu